Már kifizetett, befejezett projektek elszámolásával van probléma . Az EU Bizottság szerint 2007 és 2014 között Magyarország „nem kell körültekintéssel választotta ki a pályázatok győzteseit”, azaz nem mindig az győzött, aki a legjobb ajánlatot tette, hanem más szempontok is közre játszhattak.

Nem volt megfelelő a kiválasztási gyakorlat, amivel 2007 és 2014 között a győztes fejlesztéspolitikai EU-s pályázatokat kiválasztotta a Nemzeti Fejlesztési Ügynökség, jelentette be Csepreghy Nándor fejlesztéspolitikai helyettes államtitkár.

A bejelentés szerint 700 milliárd forintot függesztenek fel innovációs, gépbeszerzési és épületfejlesztési vonalon. Csepreghy szerint a „kritikák” miatt nem kell fejlesztést leállítani, hanem alapvetően elszámolási vitáról van szó.
Az Európai Bizottság 2014-ben folytatott átfogó vizsgálatot az operatív programmal kapcsolatban. Csepreghy szerint több ezer pályázatot néztek át.
A helyettes államtitkár többször hangsúlyozta, hogy a pályázatelbírálási gyakorlat a Bajnai-Gyurcsány érából ered. Arra a kérdésre, hogyha 2010 óta látták, hogy nem megfelelő ez a gyakorlat, miért csak 2014-ben változtatott a kormány, azt mondta, hogy
nem akarták, hogy források ragadjanak be, ezért „inkább felgyorsították a kifizetéseket”.
Csepreghy szerint a következő „órákban, napokban” próbálják korrekcióra kérni az EU Bizottságot, hogy pontosan mennyit pénzt veszíthetünk el, az nem derült ki a sajtótájékoztatón. index.hu